2000例基因组学数据发布 中国脑胶质瘤数据库免费对外开放啦

    来源:搜狐健康    发布时间:2019-07-09 09:25    编辑:山茶     浏览量:

文 / 管颜青 编 / 袁月 【搜狐健康】随着人类基因组计划的完成和基因测序技术的不断发展,我国脑胶质瘤的基础研究取得了新进展。 近日,搜狐健康从北京天坛医院获悉,中国脑胶质瘤基因组图谱计划(CGGA, Chinese Glioma Genome Atlas; http://cgga.org.cn)数

文 / 管颜青 编 / 袁月

【搜狐健康】随着人类基因组计划的完成和基因测序技术的不断发展,我国脑胶质瘤的基础研究取得了新进展。

近日,搜狐健康从北京天坛医院获悉,中国脑胶质瘤基因组图谱计划(CGGA, Chinese Glioma Genome Atlas; http://cgga.org.cn)数据库发布2000例中国脑胶质瘤样本的功能基因组学数据。经过15年的临床标本和组学数据积累,目前该数据库日臻完善,全部基因组数据向全世界研究者免费开放。据不完全统计,已有美国、欧洲多家知名研究机构近200篇SCI论文引用该数据库。

脑胶质瘤是成人最常见的颅内原发恶性肿瘤,具有手术全切困难,肿瘤异质性强,对放化疗不敏感,致残致死率高等特点。

为了探寻脑胶质瘤发生发展过程中的重要分子机制,寻找到更为有效的治疗策略,北京市神经外科研究所副所长、首都医科大学附属北京天坛医院神经外科副主任江涛从2004年起开始致力于中国脑胶质瘤生物样本库的建立及临床随访数据的收集。在我国神经外科创始人王忠诚院士的指导下,2012年江涛团队启动CGGA。

江涛介绍,此次公布的2000例中国脑胶质瘤样本的功能基因组学数据,涉及不同组织病理分类、不同WHO恶性度分级、原发/复发配对样本,功能组学数据涵盖全外显测序 (286例)、mRNA芯片(301例)及其测序(1018例)、microRNA芯片(198例)、以及DNA甲基化芯片(159例)。

这个数据库中包含了详尽的临床数据,包括患者性别、年龄、放疗和化疗情况、完整随访数据等,针对不同组学数据特点,研究团队还开发了不同的在线分析工具,包括脑胶质瘤突变图谱绘制、基因表达及其DNA甲基化的分布模式展示、相关性分析以及生存分析结果可视化等。

“希望通过基因组学技术分析,全面绘制中国人群的脑胶质瘤基因组图谱,让国内外更多从事脑胶质瘤的研究者可以对数据库进行挖掘利用。”江涛表示,该数据库的建立有助于描绘中国人群脑胶质瘤的基因组及分子遗传学特征,为脑胶质瘤的分子分型和药物靶点研发提供指导,并为脑胶质瘤精准医学全链条的发展奠定基础。

依托于国家神经系统疾病临床医学研究中心、北京市神经外科研究所,以及首都医科大学附属北京天坛医院,目前CGGA数据库已经成为亚洲乃至全世界最大规模的脑胶质瘤医学信息工程。江涛表示,不断建设和完善的CGGA数据库,将对促进我国脑胶质瘤领域基础和临床研究水平的发展并提高我国癌症研究的国际影响力,最终推动脑胶质瘤新型诊疗模式的发展,让更多脑胶质瘤患者获益起到积极作用。

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